Ekonomickou olympiádu organizačně zajišťuje Institut ekonomického vzdělávání z.ú. (INEV) a je zaštítěna Ministerstvem školství, mládeže a tělovýchovy a Českou národní bankou.
Soutěž odborně garantuje Institut ekonomického vzdělávání. Správní rada institutu se skládá z ekonomů z České národní banky a Vysoké školy ekonomické. Ekonomická olympiáda má podporu České bankovní asociace (ČBA), České asociace pojišťoven (ČAP), Asociace krajů České republiky (AKČR) a Asociace učitelů občanské výchovy a společenských věd (Občankáři).